بالرغم من أن الأعراض النفسية قد لا تكون من أعراض جرثومة المعدة الواضحة، حيث أن الجرثومة تسبب أعراضاً جسدية في الغالب، إلا أن بعض الدراسات أشارت إلى احتمالية أن يكون لجرثومة المعدة تأثير على الجانب النفسي. فوفقاً لدراسة تم القيام بها وجد أن الإصابة بجرثومة المعدة قد تؤدي إلى ظهور أعراض القلق والاكتئاب لدى بعض المرضى، مما يعني ارتباط القلق وظهور أعراضه لدى هؤلاء المرضى، وبالرغم من هذا ما زال هناك حاجة لإجراء المزيد من الأبحاث